進行菏澤乳腺癌肉瘤基因檢測公證時，需要準備以下資料：

1. 身份證明：受檢者及法定代理人的有效身份證件（如身份證、護照等），確保身份信息的真實性和合法性。

2. 醫(yī)學診斷證明：由正規(guī)醫(yī)療機構出具的乳腺癌肉瘤診斷證明書，證明受檢者確實患有該疾病。

3. 基因檢測申請表：填寫完整的基因檢測申請表，包括個人信息、疾病史、家族史等相關內容。

4. 知情同意書：受檢者或其法定代理人簽署的知情同意書，表明對基因檢測的目的、過程、風險及結果有充分了解并同意進行檢測。

5. 家族史資料：如有家族成員患有類似疾病，需提供相關家族史資料，有助于基因檢測的準確性和全面性。

6. 相關醫(yī)療記錄：包括但不限于病理報告、影像學檢查結果等，以便檢測機構全面了解受檢者的病情。

7. 公證處要求的其他材料：根據(jù)菏澤當?shù)毓C處的具體要求，可能需要提供其他相關材料，建議提前咨詢公證處。

準備好以上資料后，前往菏澤具備資質的公證處進行公證手續(xù)，確保基因檢測過程的合法性和檢測結果的法律效力。